研究探索SARS-CoV-2指数增长、高流行率及Delta相关疫苗有效性
尽管疫苗接种率很高，但是冠状病毒SARS-CoV-2感染的流行继续推动着发病率和住院率，在许多人群中，由这种病毒的Delta变体引起的病例比例在增加。随着疫苗接种计划在全球范围内的展开和社交距离的放宽，SARS-CoV-2的未来趋势并不确定。
自2020年5月以来，REACT-1（Real-time Assessment of Community Transmission–1）研究一直在跟踪COVID-19大流行病在英格兰的传播。基于英格兰5岁及以上人群的随机样本，该研究涉及每月2至3周内从约10万人或更多人那里获取自制的咽拭子和鼻拭子进行逆转录聚合酶链式反应（RT-PCR）检测。除了拭子阳性的信息外，来自英国帝国理工学院等研究机构的研究人员还收集人口统计学和其他潜在风险因素的数据，以及（自2021年1月起）疫苗接种史。患病率估计值经过加权处理，以代表整个英格兰的人口。在此，他们利用REACT-1第12轮（2021年5月20日至2021年6月7日之间）和第13轮（2021年6月24日至7月12日之间）的RT-PCR拭子阳性数据来分析流行趋势及其驱动因素。回复率（response rate），即收到有效拭子结果的受邀者的百分比，在所有轮次中为20.4%，在第12轮和第13轮中分别为13.4%和11.7%。
这些研究人员观察到，随着英格兰第三轮疫情的展开，再生数R在第12轮估计为1.44（95%可信区间为1.20，1.73），在第13轮为1.19（1.06，1.32），对应于第12轮和第13轮的平均翻倍时间分别为11天（7，23天）和25天（15，>50天）。这导致平均加权患病率从第12轮的0.15%（0.12%，0.18%）（基于108911个有效拭子中的135个阳性）增加到第13轮的0.63%（0.57%，0.69%）（98233个有效拭子中的527个阳性）。不同轮次之间和每轮次内的快速增长似乎是由Delta变体完全取代Alpha变体，以及在较年轻、较少接种疫苗的年龄组中的高流行率所驱动：在13至17岁的人群中，他们观察到第12轮[0.16%（0.08%，0.31%）]和第13轮[1.56%（1.25%，1.95%）]之间加权流行率增加了9倍。在第13轮中，报告未接种疫苗者的加权患病率[1.21%（1.03%，1.41%）]比报告已接种两剂疫苗者[0.40%（0.34%，0.48%）]高出3倍；然而，44%的感染发生在接种两剂疫苗者身上，反映出尽管总体接种水平很高，但两剂疫苗对感染的有效性仍不完善。
2021年期间，SARS-CoV-2变体替换导致感染上升，并引发了对疫苗抗感染有效性的担忧。图片来自Science, 2021, doi:10.1126/science.abl9551。
在18至64岁的参与者中，根据自我报告的疫苗接种情况，这些作者估计在第13轮中对感染的有效性（经年龄、性别、地区、种族和多重贫困指数调整）为49%（95%置信区间为22%，67%），如果只考虑强阳性[周期阈值（Ct）低于27]，则上升到58%（33%，73%）。对于同一年龄组，他们估计对感染的有效性调整后为59%（23%，78%），即在检测前一个月报告一种或多种常见的COVID-19症状（发烧、嗅觉或味觉丧失或改变、新的持续咳嗽）的人群中。除年龄外，种族、家庭规模和当地的贫困程度也共同导致了拭子阳性率较高的风险。
综上所述，从2021年5月底至7月初，在英国开展了非常成功的疫苗接种运动，疫苗接种率很高，但在未接种疫苗的年轻人中，Delta变体的感染流行率较高，推动感染呈指数增长。尽管2021年夏季北半球的增长速度放缓（或流行率持平或下降），但在Delta变体存在的情况下，增加的混合可能解释了2021年秋季发生的重新增长，即使是在疫苗接种水平较高的人群中。
注：原文有删减
参考资料：
Paul Elliott et al. Exponential growth, high prevalence of SARS-CoV-2, and vaccine effectiveness associated with the Delta variant. Science, 2021, doi:10.1126/science.abl9551.
本文来源自生物谷
